西门塔尔牛HDAC1基因SNP检测及其与屠宰性状的相关性分析

作者：杨颖; 施巧婷; 陆江; 石德顺; 徐照学; 李湘萍

来源：广东农业科学, 2016, 43(02): 128-132.

DOI：10.16768/j.issn.1004-874x.2016.02.024

• 西门塔尔牛
• 组蛋白去乙酰化酶1
• 单核苷酸多态性
• 屠宰性状

通过对37头西门塔尔牛第2条染色体上的组蛋白去乙酰化酶1基因(HDAC1)的Intron 4-Intron5、Intron 10-Intron 11和3′非翻译区进行克隆和序列分析,采用SSCP分析方法和PCR产物直接测序的方法,判定SNP基因型,并分析SNP基因型与屠宰性状的相关性。结果发现,西门塔尔牛的HDAC1基因Intron4-Intron 5以及3′端非翻译区没有突变位点;在HDAC1基因Intron 10-Intron 11区存在1个突变位点,该突变位点位于测序结果的110 bp处,为A/G突变,其中AG杂合子频率(48.6%)与纯合子GG/AA频率(51.4%)大致相当,但G等位基因频率(62%)远大于A等位基因出现的频率(38%)。经在37头西门塔尔牛屠宰样品中的背膘厚屠宰性状比较,AA基因型个体的背膘厚显著低于GG和AG型个体,提示G等位基因对生长具有正效应。

• 单位
  湖北医药学院; 河南省农业科学院; 湖北医药学院附属太和医院; 广西大学