利用基因芯片分析RNA干扰PNAS-2后凋亡相关基因表达的变化

作者：肖菲; 王海嵘; 钟华; 韩洁英; 陈芳源; 欧阳仁荣

来源：诊断学理论与实践, 2007, 6(02): 137-142.

DOI：10.3969/j.issn.1671-2870.2007.02.012

• 基因芯片
• RNA干扰
• PNAS-2
• 细胞凋亡 Genechip
• RNA interference
• PNAS-2
• Apoptosis

目的:采用基因芯片技术,比较RNA干扰法封闭U937细胞中PNAS-2基因前后,与凋亡有关基因的变化情况,从而了解PNAS-2在凋亡通路中的可能定位。方法:将急性单核细胞白血病细胞株U937分别转染已构建的靶向封闭PNAS-2的干扰质粒组和对照质粒组,合并使用流式细胞仪(FCM)筛选出GFP阳性细胞,并运用半定量PCR及实时PCR方法验证RNAi效果。采用affymetrix u133A 2.0基因芯片技术比较2组细胞间基因表达的差异。进一步通过半定量RT-PCR对其中的2条上调基因(IER3、CCL2)和6条下调基因(CASP8、CD74、VEGF、DNASE2、PRTN3、TERT)的表达...

• 单位
  上海交通大学医学院附属仁济医院