基于叶绿体SSR分子标记的苦参种质资源遗传多样性分析

作者：宋芸; 张鑫瑞; 贺嘉欣; 李政; 孙哲; 李澳旋; 乔永刚^*

来源：作物杂志, 2023, (01): 30-37.

DOI：10.16035/j.issn.1001-7283.2023.01.005

• 苦参
• 叶绿体分子标记
• 遗传多样性
• 种质资源

以来自15个不同产地的150份苦参为材料，采用cpSSR分子标记技术探究不同产地苦参种质资源的遗传多样性。结果表明，18对cpSSR引物共扩增出311个条带，检测出97.47个等位基因，平均每对cpSSR引物扩增出17.28个条带。平均检测到的等位基因数（Na）为5.415，有效等位基因数（Ne）为4.395,Shannon?s信息指数（I）为1.535，多样性指数（h）为0.748，无偏多样性指数（uh）为0.832，多态信息含量（PIC）为0.886,PIC>0.5说明18对cpSSR引物具有较高的多态性。不同产地的苦参遗传多样性丰富，其中山西武乡土河坪种质（THP）的I为1.600,Ne为4.786，其他遗传多样性指数均较大，是遗传多样性较丰富的苦参产地。居群分子方差分析（AMOVA）表明，苦参种质内个体间差异大，苦参种质内遗传变异率大于种质间的。聚类分析、主坐标分析（PCoA）和STRUCTURE软件进行的遗传结构分析结果均将不同产地的苦参分为2个类群，并且分类结果有明显的地理相关性。第1类群中的9个苦参种质主要来自山西、河北、陕西和内蒙古等地，第2类群主要来自山东、河南、江苏以及安徽等地。18对cpSSR引物在苦参内具有很好的适用性。苦参种质资源的遗传多样性研究为发掘、利用与保护苦参种质资源以及优良品种的选育提供一定的理论基础。

• 单位
  生命科学学院; 山西农业大学