小麦FT基因编码蛋白结构及功能的生物信息学分析

作者：焦义然; 陈文烨; 杨帆; 刘永伟; 董福双; 杜进民^*; 周硕^*

来源：江西农业学报, 2018, 30(10): 1-6.

DOI：10.19386/j.cnki.jxnyxb.2018.10.01

• FT基因
• 小麦
• 生物信息学
• 蛋白质结构预测
• PEBP蛋白

利用生物信息方法分析和预测小麦FT基因编码蛋白的理化性质、结构域、信号肽、跨膜区、亚细胞定位和三级结构,对不同植物FT基因编码蛋白的功能位点、密码子使用偏性和系统发育进行分析。结构表明,小麦FT基因编码177个氨基酸,编码产物为一种亲水性的脂溶性蛋白质,二级结构主要是由β折叠为主,其次分别是α螺旋和β转角,不存在信号肽和跨膜区,主要定位于线粒体中,同源建模的相似度为89.57%,除满天星外,其余植物均具有PEBP蛋白,小麦FT基因对密码子的使用具有较强的偏好性,且不同植物FT基因密码子偏性间的相似关系与系统发育分析得出的亲缘关系具有一致性。说明FT基因在不同植物长期进化过程中具有较强的保守性。

• 单位
  河北科技大学; 河北省农林科学院遗传生理研究所