基于转录组测序分析壮骨止痛方治疗去势大鼠骨质疏松症的基因表达差异

作者：陈红琼; 杨珊珊; 陈瑶; 郁洁; 雷晓明^*

来源：中医药信息, 2021, 38(06): 25-30.

DOI：10.19656/j.cnki.1002-2406.210605

• 骨质疏松症
• 转录组学
• 差异表达基因
• 外周血单个核细胞

目的:基于转录组测序分析壮骨止痛方治疗去势大鼠骨质疏松模型的差异表达基因及相关通路。方法:将12只SD雌性大鼠随机分为实验组、模型组,每组各6只,采用国内外公认的雌性大鼠去卵巢3个月造成绝经后骨质疏松模型。造模后1周开始灌胃给药,实验组给予壮骨止痛胶囊(567 mg/kg),模型组给予同体积的蒸馏水(1 m L/150 g),每天1次,连续13周。13周后大鼠腹腔静脉取血提取外周血单个核细胞及其RNA,进行RNA-Seq测序,对表达差异的基因进行筛选及KEGG功能注释分析和GO富集分析。结果:实验共筛选出149个差异表达的基因(|log2 Fold change|≥1,q <0.05),与模型组相比,实验组上调的基因有67个,下调的基因有82个;GO富集分析显示差异表达基因主要富集在细胞部分、细胞器、细胞过程、生物调节、代谢过程、绑定分子类、催化活性等;KEGG通路富集分析显示有TNF信号通路、IL-17信号通路、沙门氏菌感染三条信号通路具有显著性富集意义。结论:发现了壮骨止痛方治疗去势大鼠骨质疏松一些关键基因和通路,如Nlrp12、Oscar、LOC100359515、Csf3r等基因,以及TNF信号通路、IL-17信号通路等通路,壮骨止痛方可能是通过这些基因和通路发挥治疗效果。

• 单位
  湖南中医药大学