玉米Trihelix转录因子家族的筛选与生物信息学分析

作者：焦鹏; 邹俊岩; 蒋振忠; 曲静; 马义勇; 关淑艳^*

来源：吉林农业大学学报, 2022, 44(05): 520-527.

DOI：10.13327/j.jjlau.2022.5066

• 玉米
• Trihelix转录因子
• 生物信息学分析

Trihelix基因家族是一类调节植物逆境胁迫应答和改良作物品质过程中关键的小型转录因子家族。采用生物信息学方法从玉米全基因组数据库中筛选出43个Trihelix家族成员，为进一步探讨玉米Trihelix转录因子家族的功能，分别进行染色体定位分析、信号肽分析、亚细胞定位分析、磷酸化位点分析、系统进化树构建、蛋白质结构分析和保守基序分析。结果表明：ZmTrihelix家族成员不均匀地分布在1～10号染色体上；该蛋白家族仅有ZmTrihelix1存在信号肽；该蛋白家族83.7%定位在细胞核上，16.3%定位在叶绿体、细胞质膜和线粒体上；该蛋白家族磷酸化主要集中在酪氨酸、丝氨酸和苏氨酸残基上；该家族分为5个亚家族，分别为GT-1、GT-2、GTγ、SIP1和SH4；这些家族成员高度保守，每个亚家族均具有其特殊的结构域；该蛋白家族由多个螺旋、延伸链及转角结构组成。上述研究为探索玉米Trihelix家族成员的功能奠定了基础，进一步为玉米的品质改良和分子育种提供理论参考。

• 单位
  生命科学学院; 吉林农业大学