基于二代测序技术的MNP标记鉴别刺芹侧耳菌株

作者：魏传正; 王朦; 张鹏; 刘芳; 严俊杰; 谢宝贵; 邓优锦^*; 谢路昱^*

来源：食用菌学报, 2023, 30(01): 1-9.

DOI：10.16488/j.cnki.1005-9873.2023.01.001

• 遗传相似度
• 品种鉴定
• 二代测序
• 多聚单核苷酸多态性
• 拮抗反应

以31个刺芹侧耳（Pleurotus eryngii）菌株及福建省主栽品种‘Ple 0100’为材料，经二代测序与标记序列筛选，构建32个菌株的MNP标记数据库，结果表明，32个菌株之间的遗传相似度为1.79%～99.60%，其中DUS 16与DUS 17的遗传相似度为99.60%,DUS 02与DUS 23、DUS 30的遗传相似度均为99.01%,DUS 23与DUS 30的遗传相似度为99.20%。拮抗实验结果表明，遗传相似度高的菌株之间无拮抗现象，可能是极近似品种或相同品种。对3家刺芹侧耳生产企业的子实体、子实体组织分离物、废菌渣、菇脚进行MNP检测，发现这些样品与‘Ple0100’的遗传相似度均为100.00%，表明利用MNP标记进行品种鉴别的材料不限于菌丝体。对5个自交菌株及其亲本进行MNP标记检测，结果表明，自交菌株之间遗传相似度为26.84%～61.43%，与亲本之间的遗传相似度为28.43%～78.33%，表明刺芹侧耳减数分裂过程中存在广泛的染色体重组和同源染色体交换。对国内52家刺芹侧耳生产企业的56份鲜菇样品的组织分离物进行MNP检测，发现与‘Ple0100’的相似度均为100.00%，表明国内刺芹侧耳栽培品种高度一致。研究结果表明基于二代测序技术的MNP标记技术可用于刺芹侧耳菌株间遗传相似度分析及新菌株鉴别。

• 单位
  福建农林大学; 中国农业科学院