高校是财政科技支出的重要执行主体,如何有效评判科技创新活动的产出和成效,积极推进财政绩效预算管理的深化发展,贯彻落实党的十九大全面实施绩效管理的战略部署,是当下需要解决的重点和难点。文章以系统论为基础,针对财政科技支出绩效管理和评价应用存在的问题,以提高财政科技支出绩效评价质量为前提,提出将绩效理念和绩效要求贯穿于财政科技资金管理尤其是高校科研经费管理的全过程,优化科技资源配置,提高财政资金使用效率、效益,真正实现将绩效评价应用落到实处,由点及面地推开全面绩效管理。