贵州地方水稻种质的SSR遗传多样性及群体结构分析

作者：张建冲; 杨翠; 杨世丽; 余显权; 周丽洁^*

来源：分子植物育种, 2022, 20(11): 3664-3676.

DOI：10.13271/j.mpb.020.003664

• 水稻
• 地方品种
• SSR标记
• 遗传多样性
• 群体结构

为探明贵州地方水稻种质资源的遗传基础，本研究利用53对SSR引物对来源于贵州省内多个地区的273份地方水稻种质进行遗传多样性和群体结构分析。研究结果表明，53个SSR标记共检测到182个等位基因，每个位点的等位基因数变化范围为2～6，平均为3.43；平均有效等位基因数为2.014 5;Shannon信息指数变化范围为0.262 0～1.582 8，平均为0.778 8;Nei’s基因多样性指数变化范围为0.133 3～0.772 3，平均为0.432 5；多态信息含量变化范围为0.126 6～0.736 6，平均为0.368 0。基于Nei’s遗传距离的UPGMA聚类分析将273份资源划分为2个类群，分别包含240和33份材料；Structure群体结构分析结果划分为2个类群，分别包含242和31份材料；其中262份(95.97%)材料的Q值≥0.9，仅2份材料Q<0.6，划分到混合群。群体结构分析结果与UPGMA聚类结果大致相同。综上所述，贵州地方水稻种质资源的遗传多样性不够丰富，遗传结构基础较为单一，造成这一现象的原因可能是贵州地方水稻种质由相同或类似的种质在各地区进行流转发展而来。本研究结果为贵州地方水稻资源的有效保护和高效利用提供科学依据。

• 单位
  贵州大学