一种新型肾透明细胞癌焦亡相关基因预后风险模型的建立和验证

作者：王万里; 任伟南; 赵千; 石贞玉^*; 厉永强^*

来源：解剖学报, 2022, 53(05): 620-627.

DOI：10.16098/j.issn.0529-1356.2022.05.012

• 肾透明细胞癌
• 免疫浸润
• 预后
• LASSO Cox回归分析
• 人

目的 建立一种新型肾透明细胞癌焦亡相关基因风险模型。方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库、基因型组织表达(GTEx)数据库分别下载了522例肾透明细胞癌(KIRC)患者和72例正常组织样本。对TCGA和GTEx的数据进行差异分析，采用单因素和多因素COX回归分析以及LASSO Cox回归分析构建基因风险模型。使用国际癌症基因组联盟(ICGC)数据作为外部验证数据集。对TCGA＿KIRC队列的高、低风险组进行基因本体论(GO)富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析，探讨高、低风险组之间基因功能和通路的差异。利用CIBERSORT数据库探讨高、低风险组的免疫浸润情况。结果 通过差异分析，得到13个差异表达的焦亡相关基因。采用单因素、多因素和LASSO Cox回归分析构建1个6基因风险模型。Kaplan-Meier分析结果显示，两个队列中高风险组生存时间均短于低风险组。在TCGA＿KIRC队列中，1、2、3年曲线下面积(AUC)分别为0.710、0.683和0.727。在ICGC＿RECA队列中，1、2、3年曲线下面积为0.592、0.531和0.545。独立预后分析显示，风险分数是1个独立预后因素。GO功能富集分析和KEGG通路富集分析结果表明，其主要与免疫和炎症反应相关。肿瘤的免疫浸润结果表明，高风险组中CD4+T细胞调节性T细胞、自然杀伤细胞、单核细胞、M2巨噬细胞和嗜酸性粒细胞浸润水平低，B细胞、CD8+T细胞、滤泡辅助性T细胞浸润水平高。结论 细胞焦亡相关基因可能在KIRC肿瘤免疫中发挥重要作用，联合与细胞焦亡相关的6基因风险模型可以为KIRC患者的个性化治疗方案提供预测依据。

• 单位
  河南大学; 基础医学院