荧光定量RT-PCR检测柯萨奇病毒A组6和10型的方法建立及应用

作者：苏旭^*; 吕莉琨; 李力; 杨东靖; 李佳萌; 谭昭麟

来源：国际病毒学杂志, 2015, 22(06): 372-375.

• 手足口病
• 柯萨奇病毒A组6型
• 柯萨奇病毒A组10型
• 荧光定量RT-PCR

目的建立柯萨奇病毒A组6 (Coxsackievirus A6,CVA6)和10型(CVA10)的SYBR Green I荧光定量RT-PCR方法并进行评价及初步应用。方法根据GenBank上的CVA6和CVA10序列,分别设计特异性引物,建立SYBR Green I荧光定量RT-PCR方法体系,并分别进行灵敏度,重复性和特异性检测,然后利用该方法对649份2014年天津市未明确分型的肠道病毒阳性标本进行检测。结果成功建立CVA6和CVA10的SYBR Green I荧光定量RT-PCR方法及定量标准曲线,其检出限均为101 copies/μL,重复性实验的变异系数均小于2%。该方法特异性强,与柯萨奇病毒(A组2、4、5、16型)、肠道病毒EV71型、诺如病毒、轮状病毒、麻疹病毒和乙型流感病毒均无交叉反应。利用该方法检测649份未分型标本,发现136份为CVA6阳性和174份为CVA10阳性,分别占未分型阳性标本的20.96%和26. 81%。结论本研究建立的检测CVA6和CVA10荧光定量RT-PCR方法灵敏度高、重复性好、特异性强,应用于2014年天津市手足口病监测,发现CVA6和CVA10已成为优势型病原体。

• 单位
  天津市疾病预防控制中心