非小细胞肺癌铁死亡相关基因筛选及其与患者预后关系生物信息分析

作者：庄文珺

来源：医学理论与实践, 2022, 35(17): 2881-2887.

DOI：10.19381/j.issn.1001-7585.2022.17.001

• 铁死亡
• 肺癌
• 预后
• 生物信息

目的：探寻非小细胞肺癌(NSCLC)预后有关的铁死亡基因及其与患者总生存(OS)和无疾病进展生存(DFS)的关系。方法：GEO中选取NSCLC预后有关的表达谱数据，筛选NSCLC患者3年内死亡VS存活差异表达基因。差异表达基因与铁死亡基因集合进行比对，筛选其中与NSCLC患者预后有关的铁死亡基因，并进行KEGG和蛋白相互作用网络(PPI)分析。TCGA数据库中，根据高低表达分为高表达组和低表达组，比较高、低表达组NSCLC患者OS和DFS有无差异。结果：GSE37745数据集中，下调表达的基因18个，上调表达的基因为92个，上调或下调表达的铁死亡相关基因为SLC7A11;SLC7A11表达在不同实体肿瘤中表达存在差异，在NSCLC患者癌组织中SLC7A11表达水平显著增高(P<0.05)。SLC7A11蛋白相互作用网络(PPI)中有节点数为20个，节点间相互作用72个，平均聚类指数为0.85,SLC7A11蛋白相互作用网络蛋白富集明显(P<0.05);SLC7A11信号通路主要富集铁死亡、突触囊泡周期和蛋白质消化吸收等；SLC7A11高表达肺腺癌患者OS低于低表达肺腺癌患者(HR=1.4,P<0.05);而SLC7A11表达水平与肺鳞癌总生存和无疾病进展生存无关(P>0.05)。结论：SLC7A11为NSCLC中与患者预后有关的铁死亡基因，其高表达与肺腺癌的预后不良有关。