澄黄滨珊瑚微卫星标记的开发

作者：李福宇; 陈丹丹; 李元超; 李世尧; 侯敬; 王道儒; 王嫣^*

来源：基因组学与应用生物学, 2021, 40(Z2): 2513-2521.

DOI：10.13417/j.gab.040.002513

• 澄黄滨珊瑚
• 微卫星标记
• 遗传连通性
• 虫黄藻

本研究通过挖掘GenBank中滨珊瑚属(Porites)近缘种的EST和基因组微卫星序列资源，使用种间扩增和重测序技术，开发了澄黄滨珊瑚(Porites lutea)-虫黄藻(Symbiotic zooxanthellae)共生体的微卫星标记，并通过纯的共生虫黄藻DNA的扩增验证，确认了20个澄黄滨珊瑚微卫星标记和43个共生虫黄藻微卫星标记。在海南岛岸礁八所群体(BS, n=16)中测试扩增，有19个标记呈现多态性。多态位点的等位基因数为2～7 (平均3.5±1.8)，观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.06～0.94 (平均0.34±0.29)和0.18～0.83 (平均0.57±0.20)。由于存在无效等位基因，4个位点在经Bonferroin多重比较校正后仍然偏离Hardy-Weinberg平衡(PHWE<0.05)。这是澄黄滨珊瑚的首套微卫星标记，它们可用于对该物种遗传多样性和连通性的研究，从而促进印度洋-太平洋海区濒危的珊瑚礁生态系统及造礁珊瑚群落的保护。

• 单位
  海南大学; 海南省海洋与渔业科学院