单细胞转录组和单细胞染色质开放性图谱解析小鼠γδ T细胞异质性（英文）

作者：李振华; 杨全利; 唐欣; 陈一铭; 王闪闪; 齐晓杰; 张亚雯; 刘宗华; 骆静; 刘晖; 巴永兵; 郭练霞; 吴宝剑; 黄芳; 曹广超^*; 尹芝南^*

来源：Science Bulletin, 2022, 67(04): 408-426.

• γδ T cell
• scRNA-seq
• scATAC-seq
• Innate immunity
• Heterogeneity

γδ T细胞具有重要的免疫监视功能,其不同亚群在维持组织稳态和局部免疫反应中发挥不同作用,但是γδ T细胞的异质性尚未完全解析.本文对小鼠胸腺、脾脏和淋巴结中的γδ T细胞开展了单细胞转录和染色质开放性组学分析,系统地解析了其异质性.经典的γδ T1(IFN-γ+)和γδ T17(IL-17A+)亚群内部也存在显著的异质性,作者推断了其潜在调控机制.通过对胸腺γδ T细胞进行拟时序分析,作者构建了其发育轨迹.有意思的是,作者发现胸腺中存在一群独立于γδ T1和γδ T17的新亚群—GZMA+ γδ T细胞,并且发现该亚群具有前体细胞特征.作者还通过转录子活性分析、转录因子识别基序富集发现了一个新的γδ T17转录抑制因子—NR1D1,并利用基因敲除小鼠进行了验证.综上,本文构建了小鼠γδ T单细胞转录图谱和单细胞染色质开放性图谱,为深入解析γδ T细胞异质性和亚群调控机制提供了宝贵的资源库.

• 单位
  广州中医药大学; 暨南大学