甘薯块根响应长喙壳菌（Ceratocystis fimbriata）侵染的转录组测序分析

作者：杨冬静; 马居奎; 唐伟; 陈晶伟; 高方园; 张成玲; 孙厚俊; 谢逸萍^*

来源：江西农业学报, 2022, 34(07): 60-69.

DOI：10.19386/j.cnki.jxnyxb.2022.07.012

• 甘薯
• 长喙壳菌
• 侵染
• 转录组测序
• 抗病基因
• 调控机理

以不侵染黑斑病菌长喙壳菌(Ceratocystis fimbriata Ellis et Halsted)的抗病甘薯品种南京 92 和感病品种徐薯 18 的薯块为对照组，以侵染时间 1、3、7 d 时的薯块为处理组进行转录组测序。测序结果表明：在抗病品种中找到 36127 个差异表达基因(differential expressed genes,DEGs)，其中上调、下调表达的基因分别有 17387、18740 个；在感病品种中找到 44663 个 DEGs，其中上调、下调表达的基因分别有 22928、21735 个；在相同时间点抗、感品种间的 R1 vs S1、R2 vs S2、R3 vs S3和 R4 vs S4这 4 个对比组中有 1057 个共有 DEGs。GO富集分析结果表明：甘薯长喙壳菌侵染 3 d 时抗、感品种中富集到的前 20 的 GO 条目均主要为细胞成分，其次为生物过程和分子调控；隶属于生物过程的单一生物代谢过程、隶属于分子功能的氧化还原酶活性和四吡咯结合，以及隶属于细胞组分的质体和细胞外围等条目在抗、感品种中均被富集到。KEGG 通路富集分析结果表明：在富集的前 20 的 KEGG 信号通路中，抗、感品种中的差异基因主要被富集到代谢途径、次级代谢产物的生物合成、碳代谢、苯丙烷生物合成、柠檬酸循环 / 三羧酸循环以及光合作用等通路上。此外，对长喙壳菌侵染甘薯块根的抗性相关基因进行了分析，共鉴定出221 个抗性相关基因，其中激酶类(kinase,KIN)基因最多，有117 个，占比为 52.9%。

• 单位
  江苏徐淮地区徐州农业科学研究所