胶质瘤自噬相关长链非编码RNA的生信分析撤回

作者：李占成; 石铁; 周卫忠

来源：中国临床神经外科杂志, 2021, 26(11): 839-841.

DOI：10.13798/j.issn.1009-153X.2021.11.007

• 胶质瘤
• 细胞自噬
• 长链非编码RNA
• 预后

目的探讨胶质瘤自噬相关长链非编码RNA(lncRNA)。方法应用生信分析方法,首先检索CGGA和自噬基因列表来自人类自噬数据库(HADb),构建自噬相关lncRNA共表达网络;第二,多因素Cox回归分析胶质瘤预后相关的自噬相关lncRNA,并根据预后lncRNA计算风险评分,将胶质瘤分为低危组和高危组,采用生存曲线分析风险评分与胶质瘤预后的关系;最后,应用TCGA数据库进一步验证。结果 CGGA数据库筛选出879个lncRNA,HADb数据库筛选出216个自噬基因,构建出含402个lncRNA自噬相关lncRNA共表达网络;多因素Cox回归分析筛选出10个与胶质瘤病人预后有关的自噬相关lncRNA,而且根据这些lncRNA计算出的风险评分是胶质瘤病人预后的独立影响因素(P<0.05);生存曲线分析显示低风险组中位生存时间(1211 d)较高风险组(346 d)明显延长(P<0.05)。TCGA数据集共纳入160例胶质母细胞瘤(GBM),多因素Cox回归分析显示,风险评分是GBM独立预后影响因素(P<0.05);生存曲线分析显示低风险组中位生存时间(468 d)较高风险组(385 d)明显延长(P<0.05)。结论多个自噬相关lncRNA与胶质瘤预后相关,提示调控自噬相关lncRNA对胶质瘤具有潜在的治疗作用。

• 单位
  承德医学院