摘要
目的 鉴定并验证食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)的核心基因,探讨SPP1和POSTN表达与食管癌患者临床病理特征和预后的关系。方法 GEO数据库下载数据集GSE23400和GSE161533,R语言筛选差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)。DAVID数据库做GO富集分析及KEGG通路分析。STRING数据库构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络,Cytoscape软件鉴定核心基因(Hub genes)。GEPIA数据库验证核心基因在食管癌(包含但不限于ESCC)和正常食管组织中差异表达并评估其预后价值,免疫组化技术进一步验证SPP1和POSTN在ESCC和癌旁组织中差异表达。收集患者临床数据,分析SPP1和POSTN表达与ESCC患者临床病理特征(性别、年龄、肿瘤分化程度、淋巴转移、TNM分期、肿瘤浸润深度及肿瘤最大径)的相关性及其预后价值。结果 322个DEGs中,127个上调基因,195个下调基因。GO分析主要富集于钙离子结合、细胞质、胞外基质分配等方面;KEGG通路分析主要富集在蛋白质消化吸收和细胞外基质(extracellular matrix, ECM)受体相互作用。PPI筛选出8个核心基因,GEPIA数据库验证8个核心基因在食管癌组织均高表达(P<0.01),其中COL1A1、POSTN、COL1A2、SPP1高表达与食管癌患者预后差相关性大(P<0.05);免疫组化显示SPP1和POSTN蛋白在ESCC组织中的表达水平较癌旁组织高(分别为P<0.001和P=0.018)。其中SPP1蛋白高表达与ESCC患者的TNM分期、肿瘤大小、浸润深度(均P<0.05)相关性大;POSTN蛋白高表达与ESCC患者的TNM分期、浸润深度(均P<0.05)相关性大,SPP1和POSTN高表达ESCC患者具有更差的无病生存(disease free survival, DFS)期(分别为P=0.0109和P=0.0088)。结论 SPP1和POSTN蛋白在ESCC组织中的表达水平高于癌旁组织,且SPP1和POSTN高表达食管癌患者预后更差。
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单位河南科技大学; 河南科技大学第一附属医院