蒺藜苜蓿CBF基因家族鉴定与分析

作者:刘俊凤; 段瑞君*; 李小安*; 杨国柱; 马亚珺; 马银花; 祁存英; 杜岩功; 欧宝玺; 祁慧明
来源:分子植物育种, 2023, 1-18.

摘要

CBF [C-repeat (CRT)-binding factors]作为冷胁迫通用调控途径ICE (Inducer of CBF expression)-CBF-COR (Cold regulated)通路中的核心转录因子,在植物响应低温胁迫和提高植物抗冻性方面起到了至关重要的作用。目前虽然已有蒺藜苜蓿CBF的少量研究报道,但仍缺乏全面的蒺藜苜蓿CBF基因家族研究。本研究基于已发布的蒺藜苜蓿基因组,对蒺藜苜蓿CBF基因家族开展了生物信息学分析,共鉴定出7个蒺藜苜蓿CBF成员,并依据其在染色体的分布情况命名为MtCBF1~MtCBF7。保守基序分析表明,所有成员均含有AP2结构域,且具有高度保守性。时间进化史分析表明,最早出现的MtCBF1、MtCBF2、MtCBF3和MtCBF4可分为一组,较晚出现的MtCBF5、MtCBF6和MtCBF7聚为一组,与基因结构以及基因在染色体上的分布分析结果相一致。非生物胁迫表达分析表明,MtCBFs各成员在冷、干旱和盐胁迫下的表达趋势不一致,但总体上MtCBFs基因在冷胁迫下表达上调,而在盐胁迫和干旱胁迫下呈下调趋势。以上结果为进一步研究蒺藜苜蓿CBF基因家族的功能和紫花苜蓿等相关牧草的抗逆育种改良提供了基础。