基于高分辨率熔解曲线的常见五种皮肤癣菌分子鉴定

作者：徐娟; 吴伟伟; 郑文爱; 赵飞; 张玲; 龚杰^*; 张建中^*

来源：菌物学报, 2019, 38(08): 1323-1329.

DOI：10.13346/j.mycosystema.190088

• 荧光定量PCR
• 高分辨率熔解曲线
• 皮肤癣菌
• 几丁质合成酶1
• 分子鉴定

皮肤癣菌是浅表真菌感染的重要致病菌,常见致病菌种包括红色毛癣菌、趾间毛癣菌、絮状表皮癣菌、犬小孢子菌和内弯小孢子菌。本研究基于实时荧光PCR的高分辨率熔解曲线分析技术,以几丁质合成酶1为目标基因设计扩增引物,对经测序鉴定的上述5种皮肤癣菌进行熔解曲线分析,并在方法建立后,对已鉴定的临床菌株进行验证。实验结果表明,使用该方法上述5种皮肤癣菌均能扩增,并表现出不同的熔解曲线和熔解温度值,可有效区分;对其余对照菌及人基因均无法扩增,特异性为100%;临床菌株的熔解曲线分析结果与DNA测序结果一致。本研究提供了一种快速、准确鉴别5种常见皮肤癣菌的方法,可为临床应用和分子流行病学研究提供参考。

• 单位
  公共卫生学院; 海南省皮肤性病防治中心; 武汉科技大学; 传染病预防控制国家重点实验室; 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所; 海南省第五人民医院