肠道硫酸盐还原菌DGGE分析技术的建立

作者：刘辰雷; 殷晓晨; 龙文敏; 费娜; 赵立平; 庞小燕

来源：中国微生态学杂志, 2013, (06): 706-711+714.

DOI：10.13381/j.cnki.cjm.2013.06.017

• 硫酸盐还原菌
• 腺苷酰硫酸还原酶基因
• DGGE
• 肠道菌群 Sulfate-reducing bacteria
• Adenosine-5′-phosphosulfate reductase
• Gut microbiota

目的建立分析肠道内硫酸盐还原菌(Sulfate-reducing bacteria,SRB)组成的变性梯度凝胶电泳(Denaturing gra-dient gel electrophoresis,DGGE)技术,并用于分析10例健康人粪便样品中的SRB组成。方法从GenBank中下载13株脱硫弧菌科细菌的腺苷酰硫酸还原酶α亚基基因(aprA)的序列,利用Clustal X、Simulated PCR(SPCR)软件比较、评估了2对针对aprA基因的引物(AprA-3-FW/APS-RV和AprA-1-FW/AprA-5-RV)用于扩增粪便样品中的SRB的特异性。确定PCR引物和条件,进一步摸...

• 单位
  生命科学技术学院; 微生物代谢国家重点实验室; 上海交通大学