羊口疮病毒新疆野毒株SHZ1 B2L和F1L基因的克隆及遗传进化分析

作者：杨海波; 贺志昊; 刘昱成; 彭叶龙; 王国超; 孟庆玲; 乔军; 陈创夫

来源：石河子大学学报(自然科学版), 2013, (03): 323-327.

DOI：10.13880/j.cnki.65-1174/n.2013.03.009

• 羊口疮病毒
• 新疆野毒株SHZ1
• B2L基因
• F1L基因
• 遗传进化分析 Orf virus
• Otfv Xinjiang wild strain SHZ1
• B2L gene
• F1L gene
• phylogenetic analysis

为了研究羊口疮病毒(ORFv)新疆野毒株的遗传进化情况,参照GenBank公布的ORFv B2L和F1L基因序列,设计特异性引物,对ORFv SHZ1新疆野毒株B2L和F1L基因进行PCR扩增,克隆、测序后进行遗传进化分析。结果表明:新疆野毒株SHZ1与GenBank公布的不同地域的17个流行株相比,B2L基因核苷酸同源性为97.28%～98.86%,推导氨基酸同源性为88.65%～90.50%;F1L基因核苷酸同源性为94.56%～97.07%,推导氨基酸同源性为93.82%～95.88%。基于B2L基因的遗传进化树分析发现,SHZ1株B2L基因与我国现用疫苗株B2L基因亲缘关系较近;而基于...

• 单位
  石河子大学