木薯叶芽和花芽的转录组差异分析

作者：韦丽君; 俞奔驰^*; 吕平; 檀小辉; 雷开文; 马崇熙; 卢赛清; 唐玉娟

来源：分子植物育种, 2020, 18(07): 2108-2117.

DOI：10.13271/j.mpb.018.002108

• 木薯(Manihot esculenta)
• 转录组测序
• 花芽分化
• 开花基因

本研究以木薯花芽与叶芽为材料,通过Illumina HiSeqTM4000测序平台对其进行转录组测序,结果获得高质量序列45 010 506个、碱基数13.46 Gb,GC含量在43.5%以上、比对效率在78%以上。筛选得到3 782个差异表达基因(DEGs),其中上调2 409个、下调1 373个。DEGs涉及的主要功能有一般功能预测,翻译,复制、重组与修复,信号传导机制,次生产物合成、运输与代谢,翻译后修饰、蛋白质周转和分子伴侣,氨基酸运输与代谢,碳水化合物运输与代谢。DEGs显著富集的KEGG通路主要有植物激素信号传导、苯丙烷类生物合成、淀粉和蔗糖代谢、苯丙氨酸代谢、氨基酸的生物合成和碳代谢。获得植物开花相关基因47个,其中39个上调表达、8个下调表达。研究结果在一定程度上解析了木薯花芽分化的分子机制,并为后续的深入研究提供了基础数据。

• 单位
  广西壮族自治区亚热带作物研究所