海洋细菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定数据库的建立

作者：李艳君; 丁毅伟; 赵强元^*; 马聪

来源：解放军医学院学报, 2020, 41(07): 719-723.

• 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
• 海洋细菌
• 细菌鉴定数据库
• 病原菌
• 微生物

目的 建立海洋细菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定数据库,为海洋细菌引起各类感染的病原快速鉴定提供支持。方法 本中心课题组2006-2016年收集国内外6个海域158个采样点海洋细菌530株,分离培养后进行细菌16srDNA扩增测序,应用FlexControl软件收集蛋白谱图,Biotyper软件构建评价数据库。分别用仪器商品化数据库、自建数据库和扩展数据库进行菌种鉴定,比较各数据库的鉴定差异。结果 自建本地化海洋细菌鉴定数据库包含32个菌属,82个菌种,共计421株海洋细菌谱图。以16srDNA测序鉴定结果为金标准,验证菌株用商品化数据库鉴定时正确80株,鉴定正确率80.8%,用扩展数据库鉴定时正确97株,鉴定正确率98.0%,差异有统计学意义(P<0.001)。结论 自建海洋细菌鉴定数据库菌株的鉴定能力较商品化数据库更强,有助于海洋细菌引起相关感染的诊断和治疗。

• 单位
  解放军总医院