基于TCGA及验证分析关键lncRNA作为胃癌患者的潜在预后生物标志物

作者：舒建龙; 张顺荣^*

来源：中国中西医结合消化杂志, 2022, 30(07): 487-494.

• 长链非编码RNA
• 癌症基因组图谱
• 基因表达谱数据动态分析
• 预后风险模型

目的:构建基于长链非编码RNA(lncRNA)的胃癌(GCa)患者预后风险模型。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中检索GCa患者的RNA测序数据和临床信息，使用R软件筛选免疫相关基因及lncRNA,进行单变量和多变量Cox回归分析以构建预后风险模型、生存分析和受试者ROC曲线用于评估模型的敏感性和特异性。结果:从TCGA数据库收集的GCa患者的临床信息，以确定用于预后的lncRNA生物标志物。从375例胃腺癌(stomach adenocarcinoma, STAD)组织和32例非癌组织中根据单变量和多变量Cox回归分析，发现了6个lncRNA(AP003392.1、AL022316.1、AC005586.1、LINC01315、AP001318.2、AL161785.1)与GCa患者存活相关，被选择建立预后风险模型。基于该风险模型，高危患者和低危患者的总生存率存在显著差异。该模型的ROC曲线下面积(AUC)为0.686。基因表达谱数据动态分析(gene expression profiling interactive analysis, GEPIA)结果证实了LINC01315在STAD中的表达和预后意义。临床数据证实胃癌中LINC01315的表达较健康人群是高表达。结论:构建lncRNA预后风险模型，风险值可以作为独立预后因子预测GCa患者的预后情况，降低LINC01315表达可能在GCa患者的生存率方面发挥重要作用。

• 单位
  广西国际壮医医院