基于传统培养和宏基因组测序分析泗洪小龙虾不同部位的菌群多样性

作者：汤纯; 诸永志; 吴海虹; 孙芝兰; 朱云龙^*; 刘芳

来源：肉类研究, 2019, 33(10): 44-50.

• 克氏原螯虾
• 培养基法
• 宏基因组测序
• 微生物多样性

通过传统培养和宏基因组测序方法分析泗洪地区小龙虾整体、表面、尾肉等不同部位的菌群多样性,确定不同部位的特定污染菌组成。结果表明:小龙虾整体的初始菌数达8.4 (lg(CFU/g)),且不同部位的微生物群落有明显差异;通过宏基因组测序发现,在科水平上,黄杆菌科(Flavobacteriaceaea)是泗洪小龙虾不同部位的优势菌科,丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)、莫拉氏菌科(Moraxellaceae)和气单胞菌科(Aeromonadaceae)分别是小龙虾整体、表面和尾肉的优势菌科;在属水平上,金黄杆菌属(Chryseobacterium)、不动杆菌属(Acinetobacter)和气单胞菌属(Aeromonas)分别是小龙虾整体、表面和尾肉的优势菌属,黄杆菌属(Flavobacterium)在3个部位中相对丰度均较高。

• 单位
  扬州大学; 江苏省农业科学院