团头鲂低氧耐受相关SNPs标记的开发

作者：陈柏湘; 王伟峰; 王卫民; 王焕岭^*

来源：华中农业大学学报, 2019, 38(02): 23-29.

DOI：10.13300/j.cnki.hnlkxb.2019.02.004

• 团头鲂
• 低氧
• SNP
• 性状关联分析

为寻找耐低氧相关SNPs分子标记辅助团头鲂优良品种选育,利用团头鲂低氧耐受和敏感群体的转录组数据,进行SNPs位点的开发和鉴定,获得52 623个可能的SNPs位点,其中碱基转换和颠换型位点分别占57.4%(30 192个)和31.9%(16 802个);同义SNPs占编码区总SNPs的99.7%,非同义SNPs仅有32～35个;使用PCR-RFLP技术对筛选出的5个非同义的多态性SNPs进行耐低氧性状关联分析。结果显示,Plin2-A1157G和Hif-3α-A2917G位点的SNPs在团头鲂亲本群体中与低氧耐受性状显著相关,但在子代群体中却与低氧耐受性状无显著相关性。这说明亲代中筛选出的分子标记并不一定适用于子代群体,在利用分子标记辅助育种时需要考虑标记在子代中的有效性。

• 单位
  华中农业大学; 佛山市南海百容水产良种有限公司