版权补偿金制度对于解决图书馆数字版权问题具有积极意义。但是,版权补偿金制度自身的弊端和对现代信息技术的不适应,使得这项制度规制图书馆传播利用数字作品又存在诸多问题,比如收费标准的欠精确、与版权技术保护措施的冲突、版权集体管理组织授权中介地位的边缘化等。创新版权补偿金制度的对策包括:构建相互并存和多元化的授权制度、开展科学的制度设计与安排、变革版权交易的中介制度和机制等。