CNV-seq联合qPCR对单一基因 NRXN1部分缺失的产前诊断

作者：王丽霞; 时盼来; 任化楠; 薛淑媛; 孔祥东^*

来源：中华医学遗传学杂志, 2022, 39(11): 1200-1204.

• 低深度全基因组测序
• 产前诊断
• NRXN1基因
• 2p16.3微缺失

目的分析7例低深度全基因组测序(copy number variation sequencing, CNV-seq)检出仅涉及NRXN1基因的2p16.3杂合缺失胎儿的遗传学检查结果、拷贝数变异(copy number variation, CNV)来源及妊娠结局, 为产前诊断和遗传咨询提供依据。方法 7例产前诊断样本均通过CNV-seq检测发现2p16.3杂合缺失, 进一步通过实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR, qPCR)进行验证, 明确涉及的NRXN1基因缺失的具体区域, 并对CNV进行父母验证和妊娠结局的随访。结果在16 502例样本中共检出7例胎儿染色体2p16.3区存在120 ～ 900 kb的微缺失, 发生率为0.424‰。该区域主要位于2号染色体的50 200 000-51 880 000位置, 仅覆盖了NRXN1基因。qPCR验证了7例胎儿的CNV, 其中2例涉及NRXN1基因第1 ～ 6外显子杂合缺失, 1例涉及第1 ～ 19外显子杂合缺失, 1例涉及第19 ～ 22外显子杂合缺失, 3例涉及第6 ～ 7内含子杂合缺失。亲代验证发现父源性1例, 母源性1例, 新发2例, 其余3例拒绝亲代验证。经随访, 除1例引产, 1例尚未出生外, 其余5例均健康出生, 年龄5个月～ 3岁, 均未发现NRXN1相关的精神发育异常。结论 CNV-seq检出7例胎儿涉及NRXN1基因的2p16.3杂合缺失, 经qPCR验证NRXN1基因的具体缺失位置, 通过结合CNV来源、家系分析以及妊娠结局, 对每个家庭进行了个体化的遗传咨询及生育指导。

• 单位
  乌鲁木齐市妇幼保健院; 郑州大学第一附属医院