基于16S rRNA测序技术分析呼吸机相关性肺炎患者粪便与肺泡灌洗液菌群的相关性

作者：雷萌萌; 张小亚; 杨小娟; 景佩; 杨明月; 杨晓军^*

来源：中华危重病急救医学, 2021, 33(02).

• 呼吸机相关性肺炎
• 肺泡灌洗液
• 肠道菌群
• 16S rRNA
• 细菌移位
• 肺-肠菌群相似度

目的探讨呼吸机相关性肺炎(VAP)患者肠道和肺部微生态结构变化及其之间的相关性。方法采用前瞻性观察性研究方法, 纳入2019年5月1日至2020年5月1日入住宁夏医科大学总医院重症医学科的31例VAP患者, 收集患者同一天的粪便及肺泡灌洗液样本, 利用16S rRNA测序技术对粪便和肺泡灌洗液样本进行菌群组成及结构的生物学信息分析, 综合测序结果及患者临床资料进行统一分析。结果① VAP患者肺泡灌洗液中菌群α多样性(丰度及多样性)较粪便菌群增高, 其中描述菌群丰度的Ace指数、Chao指数及描述多样性的Shannon指数差异有统计学意义〔Ace指数:305.89(214.39, 458.66)比204.51(165.15, 247.61), Chao指数:259.83(194.20, 459.31)比187.67(153.28, 234.01), Shannon指数:3.01(2.39, 3.54)比2.55(1.86, 2.95), 均P<0.05〕, 描述多样性的Simpson指数差异无统计学意义〔0.14(0.08, 0.27)比0.19(0.10, 0.33), P>0.05〕。②在VAP患者粪便及肺泡灌洗液测序结果中均存在一些肠道相关菌群, 如大肠杆菌属、粪肠杆菌属、拟杆菌属及毛螺菌属等, 且丰度均较高。③ 31例VAP患者中有20例肺泡灌洗液临床培养发现可疑致病菌, 分别为草绿色链球菌6例、大肠杆菌5例、肺炎克雷伯菌3例、鲍曼不动杆菌3例、金黄色葡萄球菌2例、铜绿假单胞菌1例, 且与对应的肺泡灌洗液测序一致, 其中17例患者粪便测序中也存在这种可疑致病菌。④ 14例患者合并脓毒症, 从未发生脓毒症的患者中选取14例进行样本量匹配, 结果显示, VAP合并脓毒症组描述肺-肠菌群相关性的Jaccard相似性指数较VAP组显著升高, 差异有统计学意义(0.24±0.08比0.19±0.06, P<0.01)。结论 VAP患者存在一定的肺-肠菌群相关性, 在排除来源于环境和上呼吸道微吸入导致的肺部感染外, 仍有一部分感染源可能来自于下消化道。

• 单位
  宁夏医科大学总医院; 宁夏医科大学