沙眼衣原体omp1基因VS1-VS2序列分析与基因分型

作者：郑和平; 江丽芳; 方丹云; 吴兴中; 李燕娃; 许刚; 薛耀华; 冯占芹; 吴亚安; 黄进梅

来源：中华皮肤科杂志, 2007, (05): 277-279.

• 衣原体
• 沙眼
• 序列分析
• DNA
• 基因型
• 突变 Chlamydia trachomatis
• Sequence analysis
• DNA
• Genotype
• Mutation

目的探讨沙眼衣原体omp1基因VS1-VS2序列基因分型和VS1-VS2基因突变率。方法巢式PCR扩增omp1基因的VS1-VS2序列,自动测序仪测序,运用DNAstar软件进行临床菌株与标准菌株序列的比对。结果99株临床标本分离株扩增出约453 bp大小的VS1-VS2片段。与标准株比对,除3株测序出现双峰无法确定基因型外,96株菌株分为9个型,以F型29株(30.2%)、E型22株(22.9%)、J型19株(19.8%)、D型12侏(12.5%)和H型8株(8.3%)为主。序列分析发现7株存在VS1区碱基的突变或插入,多为有义突变,突变率为7.3%,多见于D、E、F和H型。结论沙眼衣原体o...

• 单位
  佛山市皮肤病防治所; 中山大学; 广东省皮肤性病防治中心