一例PPRV阳性羊鼻拭子样本N、P、M、F、H基因的序列测定和遗传进化分析

作者：赵文华; 李富祥; 尹伟; 杨仕标^*

来源：现代畜牧兽医, 2020, (12): 8-13.

• 小反刍兽疫病毒
• 普通RT-PCR
• N、P、M、F、H基因
• 序列测定
• 遗传进化分析
• 基因Ⅳ型

为对采集自昆明某大型牲畜交易市场的一例PPRV阳性鼻拭子样本进行追根溯源,设计引物采用RT-PCR方法进行PPRV病毒基因组关键基因N、P、M、F、H核苷酸序列扩增,并进行序列测定和遗传进化分析。结果显示:N、P、M、F、H基因均有预期片段扩增,其读码框(ORF)长度分别为1 578、1 531、1 008、1 641及1 830 nt;N、P、M、F及H构建的遗传进化树均显示所测毒株为基因Ⅳ型,同2013年在新疆伊犁山羊中检测到的毒株(KM091959)同源性最高,N、P、M、F、H核苷酸同源性分别为99.2%、99.0%、99.4%、99.6%和99.3%,推断氨基酸同源性分别为98.7%、98.4%、100.0%、99.8%和99.3%。研究表明,检测到的毒株仍为2013～2014年我国PPRV流行期的基因Ⅳ型毒株,变异较小;所测毒株的N、P、M、F、H 5个关键基因中,M基因最保守、其次是F/H基因,而N、P基因略有变异。

• 单位
  云南省畜牧兽医科学院