本发明属于医疗领域,具体涉及用于诊断功能性消化不良的方法、系统、装置及存储介质。步骤如下,获取待测体的待测脑影像信息与对照组的对照脑影像信息;分别对所述待测脑影像信息和所述对照脑影像信息进行特征提取,得到待测特征和待训练特征;根据所述待训练特征构建随机森林分类模型;根据所述待测特征和所述随机森林分类模型得到诊断结果。本发明使得诊断功能性消化不良的过程更加简单、诊断率大大提升,并且还降低了患病个体在诊断过程中的痛苦。