随着温室气体排放增加,全球变暖,征收碳税和实施碳排放交易机制被认为是碳减排最有效的手段,本文针对我国集装箱班轮企业建立考虑碳税和碳排放交易机制的双层规划模型,设计果蝇优化算法基于MATLAB实现船队配置及船速的优化。结果表明:碳税水平会影响企业参与碳交易的决策;随着碳税的提升,班轮企业在碳交易市场上的交易量呈先降后升的走势,同时企业降低船速,减少闲置船舶,通过增加运力来弥补降速导致的运力下降。