荧光定量PCR对FEN1敲低细胞株转录组测序结果的验证

作者：苏倩; 吴洁; 杜佳慧; 杨凡; 袁濮玉; 刘松柏^*; 邱秀芹^*

来源：重庆医学, 2019, 48(15): 2528-2531.

• 荧光定量PCR
• FEN1
• RNA,信使
• 转录组
• 测序
• 基因敲低技术

目的探讨DNA分枝结构特异性内切酶-1(FEN1)基因敲低细胞株及对照细胞株的差异表达基因,用实时荧光定量PCR方法进行结果验证。方法从293T野生型及293T FEN1敲低细胞株中提取RNAs,并反转录成cDNA;挑选10个转录组测序中差异表达的基因,设计引物,利用SYBR Green染料法,定量检测挑选基因的表达情况。结果挑选的10个差异表达基因中,成功扩增了其中7个基因;通过实时荧光定量PCR方法对两组细胞的7个基因进行定量检测发现,与转录组测序结果相比较,其中有2个没有明显差异,另外5个基因荧光定量方法的检测结果与转录组测序结果一致。结论在细胞内基因表达水平检测中,为提高转录组测序结果的可靠性,还需通过实时荧光定量PCR方法对其结果进一步验证。

• 单位
  苏州卫生职业技术学院