柳叶芹叶绿体基因组组装与序列特征

作者：闫嵩; 柳驰; 任伟超; 刘秀波; 徐姣^*; 马伟^*

来源：东北林业大学学报, 2022, 50(02): 49-99.

DOI：10.13759/j.cnki.dlxb.2022.02.009

• 柳叶芹
• 叶绿体基因组
• 系统发育
• 伞形科

以2020年5月31日采自黑龙江省伊春市的柳叶芹(Czernaevia laevigata turcz.)为试验材料，利用十六烷基三甲基溴化铵法(CTAB)提取基因组DNA,采用Illumina NovaSeq平台进行高通量测序，得到柳叶芹完整的叶绿体基因组序列，分析柳叶芹叶绿体基因组组装、序列特征、系统发育。结果表明：柳叶芹叶绿体基因组总长度146 161 bp,包括1个大单拷贝区长度为93 538 bp、1个小单拷贝区长度为17 779 bp,由2个反向重复序列分别分隔，每个反向重复序列为17 422 bp。对柳叶芹叶绿体全基因组共鉴定出133个基因。系统发育分析表明，柳叶芹与疏叶当归有密切的亲缘关系。柳叶芹的叶绿体基因组序列，为研究伞形科其他植物提供了较为详细、完善的资料，为该物种鉴定以及群体和个体水平的遗传差异分析提供了新的方法。

• 单位
  黑龙江中医药大学