摘要
为了对10份广西野生铁皮石斛种质资源进行遗传多样性分析,本研究以高多糖野生铁皮石斛嫩叶为材料,通过响应面优化法对影响DNA提取质量的植物组织量、CTAB浓度和水浴时间进行优化,在获得最佳提取方法的基础上,通过正交实验对铁皮石斛的SCoT-PCR反应体系中DNA模板量、引物浓度和2×Es Taq PCR Master Mix用量3个影响因素进行优化,建立最佳的SCoT-PCR反应体系;利用Popgene32.0及NTSYS-pc软件对10份铁皮石斛种质进行遗传多样性分析。结果表明,提取铁皮石斛总DNA的最佳方法为:植物组织量125 mg、CTAB浓度3%、水浴时间20 min,在此条件下,DNA提取浓度为263.2±17.5 ng/μL;最优SCoT-PCR反应体系(20 μL)为:1 μL DNA模板(40 ng/μL)、1.2 μL引物(10 μmol/L)、9 μL Mix混合液,8.8 μL ddH2O;广西野生铁皮石斛种质间遗传差异较大,观测等位基因数(Na)在1.666 7~2.000 0之间,平均值为1.882 7;有效等位基因数(Ne)在1.314 1~1.727 7之间,平均值为1.589 8;基因多样性指数(H)在0.206 7~0.414 0之间,平均值为0.337 6,香农信息指数(I)在0.322 8~0.602 6之间,平均值为0.497 8,10份铁皮石斛种质遗传相似系数为0.54~0.77。本研究通过SCoT分子标记揭示了10份广西野生铁皮石斛种质的遗传多样性,为种质鉴定、育种实践及分子遗传研究提供理论依据。
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