假单胞菌属中新型IncpGRT1质粒的遗传特性及其潜在传播风险

作者：李昕悦; 王鹏; 陈方舟; 穆小飞; 卢秀慧; 贺家琪; 郑亚丽; 周冬生^*; 殷喆^*

来源：安徽医科大学学报, 2023, 58(08): 1261-1266.

DOI：10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2023.08.003

• 假单胞菌属
• 移动元件
• 质粒
• 比较基因组学

目的 分析来自假单胞菌的IncpGRT1质粒的基因组结构和遗传特征，阐明其潜在的传播风险。方法 对临床分离菌株15420352进行分纯和保种后提取基因组DNA,随后进行全基因组测序。测序获得了质粒p420352-strA的完整序列，并对其进行质粒型别判断。对所有5个已测序的同型别质粒进行了骨架区和外源插入区的精细注释，其中包括本研究中测序的1个质粒p420352-strA和来自GenBank的4个质粒。主要通过RAST、Plasmidfinder、Blast、ResFinder和ISfinder等核定质粒的ORFs并筛查耐药毒力等相关的关键基因。结果 5个质粒被划分为新的IncpGRT1型质粒。它们均存在保守的IncpGRT1骨架标记，除主复制子repAIncpGRT1外，还筛查到这些质粒均获取了一个辅复制子。5个IncpGRT1质粒携带了至少3个不同的主要外源插入区：srp区域、msr区域、Tn5053家族转座子。这些质粒中共发现3个已知的涉及2类抗生素耐药和重金属抗性的基因：strA、strB、mer。并发现在这些质粒里携带了至少1种毒力因子msr和5种关键的转运蛋白srp、emrE、mod、phn及lpt。结论 IncpGRT1型质粒已经成为一些耐药基因及毒力基因在假单胞菌属中积累和传播的重要载体，并提高了菌株的环境适应性。

• 单位
  安徽医科大学; 基础医学院; 病原微生物生物安全国家重点实验室