科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
目的 对致病性耶尔森氏菌中的前噬菌体的分布情况及其基因组特征、毒力基因进行分析研究，以前噬菌体的角度，为进一步研究噬菌体与细菌的共进化关系提供线索。方法 以具有完整染色体以及质粒基因组序列的82株致病性耶尔森氏菌完成图为研究对象，通过PHASTER(phage search tool enhanced release)软件对致病性耶尔森氏菌的基因组完成图进行前噬菌体预测，利用CARD(comprehensive antibiotic research database)、VFDB(virulence factors database)分析前噬菌体携带的耐药基因、毒力基因。结果 82株致病性耶尔森氏菌基因组噬菌体序列携带率为100%,共预测到860个前噬菌体序列，其中完整型前噬菌体片段177个，其余683个属于噬菌体元件。每株致病性耶尔森氏菌所携带的全部前噬菌体占其基因组比例为1.7%～11.7%。35个小肠结肠炎耶尔森氏菌前噬菌体片段携带59个毒力基因，17个假结核耶尔森氏菌前噬菌体片段携带40个毒力基因，58个鼠疫耶尔森氏菌前噬菌体片段携带255个毒力基因。此外，共线性对比发现前噬菌体Haemophilus phage Aaphi23与鼠疫菌pTP33质粒高度同源且共线性好，同时发现前噬菌体Salmonella phage SSU5不但与pMT1质粒高度同源而且携带5个鼠疫菌重要毒力基因。结论 82株致病性耶尔森氏菌普遍携带前噬菌体，前噬菌体是耶尔森氏菌毒力基因的重要来源，鼠疫菌前噬菌体Salmonella phage SSU5携带鼠疫菌重要毒力基因。前噬菌体Haemophilus phage Aaphi23、Salmonella phage SSU5以质粒的形式存在或是质粒的一部分。
- 单位
