基于高通量测序的厚唇裸重唇鱼微卫星分子标记筛选

作者：刘峰林; 王泽松; 王太; 邓嘉俊; 王小东; 金燕君; 宋昭彬^*

来源：动物学杂志, 2023, 58(06): 817-826.

DOI：10.13859/j.cjz.202322297

• 厚唇裸重唇鱼
• 高通量测序
• 微卫星分子标记

本研究对厚唇裸重唇鱼(Gymnodiptychus pachycheilus)基因组进行Illumina Hi Seq高通量测序，共获得85 905条序列，包含567 200个微卫星位点，从中筛选出15个微卫星位点，采用雅砻江新龙种群和黄河渭河种群对其多态性进行了验证。新龙种群中，15个位点的平均等位基因数为6.9(3～13)，观测杂合度(Ho)为0.712 4，多态信息含量(PIC)为0.630 3，有8个位点显著偏离哈迪-温伯格平衡，1对位点表现出连锁。渭河种群中，15个位点的平均等位基因数为8.4(4～16)，观测杂合度(Ho)为0.719 5，多态信息含量(PIC)为0.680 7，有7个位点显著偏离了哈迪-温伯格平衡，4对位点表现出连锁。筛选获得的15个微卫星位点多态性较高，适合用于厚唇裸重唇鱼种群遗传学研究。

• 单位
  生物资源与生态环境教育部重点实验室; 生命科学学院; 四川大学; 甘肃省水产科学研究所; 甘肃省冷水性鱼类种质资源与遗传育种重点实验室