摘要
为阐明五指毛桃(Ficus hirta Vahl)遗传背景和亲缘关系,本研究采用核基因组分型技术(Genotyping-by-Sequencing, GBS)对采集于5个省份的29份五指毛桃的群体遗传结构和遗传分化特征等进行了研究。结果显示:(1)从29份五指毛桃样本中获得有效数据50.906 Gb,高质量SNP位点为105 226个,Q20≥93.85%、Q30≥83.98%,GC含量分布在36.24%~37.68%;(2)进化树分析结果显示29份不同省份来源的五指毛桃可被分为3组,来自广东、广西和福建的五指毛桃亲缘关系较近,主成分分析和群体遗传结构分析结果与进化树结果相一致;(3)广西桂林种群的多态位点百分率、核苷酸多样性π、近交系数(Fis值)的数值最高,而湖南郴州的观测杂合度(Ho)、群体核苷酸多样性值(π)最低。上述研究表明五指毛桃的种质资源的遗传结构明显,遗传多样性较好,其中广西桂林野生五指毛桃种群遗传多样性丰富、生存适应能力强、有较高的应用潜力,可作为核心种质开发。本研究为后期五指毛桃种质资源开发利用提供了理论依据。
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