申克孢子丝菌双相转换差异表达基因的生物信息学分析

作者：周汛; 杨致邦; 肖异珠

来源：中国生物制品学杂志, 2011, (09): 1022-1027.

DOI：10.13200/j.cjb.2011.09.31.zhoux.005

• 申克孢子丝菌
• 抑制性消减杂交
• 基因文库
• 生物信息学分析 Sporothrix schenckii
• Suppression subtractive hybridization(SSH)
• Gene library
• Bioinformatics analysis

目的探讨申克孢子丝菌菌丝相(Mycelium,M)和酵母相(Yeast,Y)双相转换的分子机制,筛选与其双相转换相关的差异表达基因。方法应用抑制性消减杂交技术,构建申克孢子丝菌菌丝相和酵母相的正反cDNA消减文库,并对其差异表达的基因进行生物信息学分析。结果 M Y文库获得751条表达序列标签(Expressed sequence tags,ESTs),经拼接后获得101条非冗余序列(Unigenes);Y M文库获得875条ESTs,拼接获得249条Unigenes。申克孢子丝菌酵母相和菌丝相的转换伴随着不同菌相细胞差异基因的高表达,这些高表达的差异基因可分为结构基因类、代谢酶类、细胞表面分...

• 单位
  重庆医科大学附属儿童医院; 重庆医科大学附属第一医院; 重庆医科大学