DNA硫修饰结合蛋白识别序列的表征与拓展促进新型核酸检测技术发展(英文)

作者:帅玉婷; 许安安; 李甲乙; 韩照晰; 马蒂尼; 段海容; 王馨叶; 蒋岚; 张敬宇; 谭高翼; 刘雪婷; 赵一雷; 童垚俊; 王申林; 贺新义; 邓子新; 刘光*; 张立新*
来源:Science Bulletin, 2023, 68(16): 1752-1756.

摘要

DNA硫修饰是一种DNA磷酸骨架上的非桥接氧原子被硫原子所取代的修饰,属于原核生物表观遗传标志物之一,它对细菌防御系统、抗氧化应激和基因调控等生命过程具有重要影响.DNA硫修饰可以被硫修饰依赖限制性核酸内切酶的硫结合域SBD特异性识别,这使其具有被开发为新型生物技术工具的潜力.然而目前关于SBD蛋白识别序列的研究仍比较粗浅且仅限于少数天然序列模式,这极大限制了其应用开发.因此,我们建立了一种针对SBD蛋白识别序列表征的技术(SBS-seq),用于对SBD的完整识别序列进行高分辨率表征.而且,采用在DNA上串联多个硫修饰的方案来提高SBD的结合亲和力并拓展了其序列识别范围.在此基础上,我们进一步优化了基于SBD和硫修饰DNA的新型核酸检测技术.本工作为硫修饰依赖限制性核酸内切酶的研究提供了思路和范例,并促进了硫修饰DNA相关生物技术的应用.