猪链球菌rpoE基因克隆及生物信息学分析

作者：杜炎斌; 张港琛; 王瑜欣; 刘宝宝; 宫胜龙; 东笑; 汪洋^*

来源：浙江农业学报, 2020, 32(07): 1149-1154.

DOI：10.3969/j.issn.1004-1524.2020.07.02

• 猪链球菌
• RpoE
• 克隆
• 生物信息学

本研究旨在克隆猪链球菌rpoE基因,并通过生物信息学软件预测分析猪链球菌rpoE基因编码蛋白功能及其调节机制。以猪链球菌基因组为模板扩增rpoE基因,成功测序后通过生物信息学软件预测该基因编码蛋白的理化性质、抗原表位等。结果表明,成功克隆的猪链球菌rpoE基因全长582 bp,编码一种富含谷氨酸、天冬氨酸及丝氨酸的亲水性胞质蛋白;二级结构分析显示,RpoE蛋白主要结构元件为α-螺旋和无规则卷曲,分别占52.3%和36.3%。综合分析认为,RpoE蛋白上存在5个优势抗原表位。

• 单位
  河南科技大学; 动物科技学院