汉麻Alfin-like转录因子家族鉴定及表达分析

作者：陈晗; 徐洪国; 王志刚; 高美玲; 祁宏英^*

来源：安徽农业大学学报, 2023, 50(03): 410-415.

DOI：10.13610/j.cnki.1672-352x.20230625.001

• 汉麻
• Alfin-like
• 成员鉴定
• 生物信息学
• 表达分析

对汉麻Alfin-like转录因子家族进行鉴定和生物信息学分析，为Alfin-like转录因子调控汉麻生长发育及抗性奠定基础。通过利用拟南芥Alfin-like转录因子蛋白序列作为模板，利用TBtools、MEGA等生物信息学工具分析汉麻全基因组数据。在汉麻基因中共鉴定出5个CsALs基因，对其进行了理化性质分析、亚细胞定位、保守基序、基因结构、染色体定位、顺式元件、共线性分析、进化分析及聚类分析等基础分析。结果表明：鉴定的5个汉麻AL转录因子均含有DUF3594结构域（PAL结构域）和PHD手指状结构域；经理化性质分析得出，CsALs蛋白质长度在239～256 aa之间，等电点在4.97～5.31之间，亲水性为–0.809～–0.623，属于酸性亲水蛋白；CsALs基因分布在4条染色体上，亚细胞定位发现AL转录因子均定位在细胞核；上游2 000 bp启动子元件分析与光响应、胁迫响应和激素相关；根据与拟南芥、大豆、水稻、玉米、烟草等系统发育分析共分为B、E、F3个亚族；热图聚类分析表明CsALs基因在汉麻中具有较高表达。

• 单位
  齐齐哈尔大学