2型糖尿病外周血长链非编码RNA-微小RNA-mRNA网络构建及功能富集分析

作者：朱璇; 张盼^*; 娄培安; 陈培培; 乔程; 董宗美; 李婷; 刘德

来源：中国糖尿病杂志, 2021, 29(09): 675-682.

• 糖尿病,2型
• 长链非编码RNA
• 竞争性内源RNA
• 生信分析

目的本研究通过构建长链非编码RNA(lncRNA)-微小RNA(miRNA)-mRNA网络和功能富集分析,预测参与T2DM外周血竞争性内源RNA(ceRNA)机制的关键lncRNA,以发现DM新的标志物或治疗靶点。方法采用基因芯片技术检测T2DM外周血差异lncRNA的表达谱,采用R语言及相关生物信息学工具处理芯片数据,预测靶基因,构建lncRNA-miRNA-mRNA网络,对差异lncRNA进行KEGG通路及GO功能富集分析,并预测关键lncRNA。结果相关性分析得到关系对2016对,包括125个lncRNA和163个mRNA。KEGG及GO分析显示有多个通路与T2DM的发生发展有联系。根据相关性分析以及软件预测数据,成功构建了lncRNA-miRNA-mRNA网络,包括21个miRNA、12个mRNA、82个lncRNA和187个相互作用关系对。预测工具筛选出6个关键lncRNA。结论 lncRNA可能通过ceRNA机制介导了DM的发生发展,其关键lncRNA可能成为未来新的DM筛查标志物或治疗靶点。