凤仙花属植物SSR-PCR反应体系的建立与优化

作者：罗超; 黄武略; 朱佳鹏; 冯志熙; 刘应丽; 黄海泉^*; 黄美娟^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(17): 5790-5799.

DOI：10.13271/j.mpb.018.005790

• 凤仙花
• SSR-PCR
• 体系建立
• 正交试验

SSR-PCR反应体系的建立与优化是凤仙花属植物(Impatiens L.) SSR标记研究的基础,本研究以8种凤仙花属植物为试材,对Mg2+、Taq酶、dNTPs浓度、DNA模板、引物浓度等5因素进行L16(45)正交试验,探讨适合凤仙花属植物的SSR-PCR反应体系,并对主要因素进行优化。结果表明:Mg2+、Taq酶和dNTPs浓度3个因素对凤仙花属SSR-PCR扩增结果有显著影响,影响程度为Mg2+>Taq酶>dNTPs浓度>DNA模板>引物浓度;20μL为最佳反应体系,其中,2.6 mmol/L (含10×PCR Buffer)的Mg2+,1.6 mmol/L的dNTPs,2μmol/L的引物,60 ng的DNA,0.1 U的Taq酶,ddH2O补齐剩余部分。利用优化后的反应体系对同属54种材料进行PCR扩增,扩增产物在130～200 bp,具4个等位基因,目标条带清晰,多态性良好。该体系的建立可为今后利用SSR标记对凤仙花种质鉴定、遗传多样性分析、系统发育研究、遗传图谱构建、基因定位和分子标记辅助育种等研究提供了依据。

• 单位
  西南林业大学