科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
目的分析儿童恶性疟疾患者外周血基因表达谱、关键蛋白的改变及其生理学功能,为疟疾防治提供新依据。方法从基因芯片公共数据库GEO中获得疟疾患儿外周血基因芯片数据,共5例疟疾患儿,均依据WHO疟疾诊断标准明确诊断,采用自体匹配设计,每位患儿分别在轻症、重症疟疾时采集外周血;分析不同病情患儿的基因表达谱、蛋白相互作用网络、分子生物学过程、基因功能,寻找疟疾患儿病情进展相关的关键基因。结果 623个(1.93%)差异表达基因可鉴别区分轻症、重症患儿;OAS2,OAS3,IFIT3和USP18基因是差异基因蛋白-蛋白交互作用网络(protein-protein interactions,PPI)中子网络的核心节点;差异表达基因主要参与机体的免疫防御、免疫应答、对外部刺激应答、干扰素-1型通路的活化等生物学功能。结论疟疾患儿病情的进展可能受OAS2,OAS3,IFIT3和USP18等基因的调控,儿童的免疫防御能力下降与病情进展具有重要的关系。
- 单位
