伊犁马毛色性状的全基因组关联分析

作者：刘玲玲; 孟军; 菲茹扎; 王琼; 曹行; 刘武军^*

来源：中国畜牧杂志, 2021, 57(06): 116-119.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20200827-06

• 伊犁马
• 毛色
• 全基因组关联分析
• MC1R基因

实验旨在利用全基因组关联分析(GWAS)挖掘影响伊犁马毛色性状的关键基因,探究马毛色性状的遗传基础。本研究基于670K高密度芯片,利用卡方检验对129匹伊犁马的毛色性状进行关联分析,探索影响毛色性状的相关基因。利用Plink1.9软件对个体和SNP位点进行质控,质控后剩余119个个体和494 137个单苷酸多态性位点(SNP)用于后续关联分析。通过基因组水平的Bonferroni校正,发现位于3号染色体上的2个SNP与毛色性状显著关联(P<5.19E-7),39个基因被注释出,经检索后发现MC1R基因与毛色性状有关。

• 单位
  新疆农业大学; 动物科学学院