氨基酸广义疏水标度(GH-scale)用于HLA-A~*0201限制性CTL表位定量预测

作者：周鹏; 李志良; 田菲菲; 张梦军

来源：科学通报, 2006, (11): 1259-1263.

• 广义疏水标度
• HLA-A*0201
• CTL表位
• 定量构效关系
• 遗传偏最小二乘

将天然氨基酸149个疏水性质经主成分分析得到了一种新氨基酸描述子——氨基酸广义疏水标度(GH-scale)．用GH—scale结合遗传偏最小二乘(GPLS)算法对152个HLA-A*0201限制性CTL表位进行定量构效关(QSAR)研究．所建模型拟合及交叉检验复相关系数分别为Rcum2=0．813和Q2=0．725．研究表明,疏水作用在CTL表位与HLA-A*0201结合过程中扮演极其重要角色,而锚定残基是该类作用发生最显著的部位．

• 单位
  化学生物传感与计量学国家重点实验室; 化学化工学院; 第三军医大学