摘要
目的 鉴定冈田绕眼果蝇(Phortica okadai)PoOBP56基因,并对其进行生物信息学及组织表达模式分析。方法 从P.okadai头部转录组数据中筛选出高表达量基因PoOBP56,并对其进行PCR验证;基于生物信息学方法分析PoOBP56编码蛋白的结构特征,包括PoOBP56蛋白基本理化性质、蛋白疏水性、蛋白跨膜区域、蛋白信号肽结构、蛋白功能域、蛋白糖基化位点、磷酸化位点及其二、三级结构,并构建系统进化树;应用RT-qPCR(实时荧光定量PCR)检测该基因在蝇体组织部位的表达差异。结果 从冈田绕眼果蝇头部转录组中筛选出1条具有完整编码区的气味结合蛋白(Odorant-binding protein, OBPs)基因序列,该基因包含806 bp的开放阅读框,编码143个氨基酸,蛋白相对分子质量为66.5×103,无跨膜结构。同源序列比对显示,该蛋白氨基酸序列与斑翅果蝇(Drosophila suzukii)、Drosophila biarmipes等科果蝇相似性高,与黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)相似性存在差异。RT-qPCR检测雌蝇PoOBP56基因触角表达量较高,雄蝇触角、蝇足和蝇翅的表达量较高,雄翅表达量高于雌翅(P<0.05),雌雄其余相同部位间表达量差异无统计学意义(P>0.05)。结论 本研究筛选出冈田绕眼果蝇PoOBP56基因,该基因主要在其触角高表达,编码蛋白与斑翅果蝇高度同源,为进一步揭示果蝇-环境间的化学通讯机制以及蝇媒防治措施的制定奠定了基础。
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单位黔南民族医学高等专科学校; 遵义医科大学